Yu ☆ Gi ☆ Oh! Arc-V céntrase en torno a Yuuya Sakaki, un misterioso duelista de entretemento coñecido como "O fantasma" xunto coas súas outras tres personalidades: Yuuto, Yuugo e Yuuri. Leo Corporation foi perseguido por piratear a súa visión sólida con sistema de masas e usouna para o seu propio propósito.
Mentres está en marcha, coñece a Yuzu Hiiragi, a filla do director da escola Syu Zo Duel que estaba a piques de quebra e enganou a Yuuya a un contrato para converterse en profesora na súa escola. Non obstante, antes de que Yuuya puidese ensinar na escola, primeiro debe atopar unha tarxeta chamada Genesis Omega Dragon que dicía que determinará o destino do mundo que tamén conectou ás súas memorias espalladas.
A historia está ambientada nunha versión alternativa de Miami City onde Leo Corporation, dirixida polo seu presidente Reiji Akaba, domina a maior parte do sistema Solid Vision en toda a cidade. A difusión da Solid Vision da compañía con masa non só deu a luz a "Action Duels", senón que tamén axudan a mellorar a cidade salvando vidas e reparando danos en caso de desastre, converténdose nun elemento vital
